Klinisch toepassingsgebied: Tijdens de zwangerschap scheidt de foetus AFP af in het amnionvocht. Vanuit het amnionvocht diffundeert het AFP in het materneel serum. Een open neuraal tube defect (spina bifida) zorgt ervoor dat AFP direct van de foetale capillairen in het amnionvocht terechtkomt. Daarom kan een verhoogde hoeveelheid amnionvocht en een verhoogd materneel AFP een indicator zijn voor een reeks foetale abnormaliteiten als anencephaly en spina bifida. Tijdens de zwangerschap wordt AFP bepaald voor detectie van hoog risico patiënten. Verhoogde waarden zijn ook geassocieerd met meerlingzwangerschap. Verhoogde waarden komen voor bij primair hepatocellulair carcinoom en niet seminomateuze testicullaire kankers. AFP wordt ook gebruikt voor therapiemonitoring. Verhoogde AFP waarden worden ook gezien bij niet maligne leveraandoeningen. AFP wordt in combinatie met totaal HCG gebruikt bij de tweede trimester down screening (dual test). De risico-analyse gebeurt van de Ssdw-software van Roche.